サービス内容
LabForgeでは、生命科学研究を中心に、 データ解析・構造解析・創薬支援・研究業務効率化など、 研究者向けの技術支援サービスを提供しています。
DNAデータ解析
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RNA-seq解析
RNA-seqデータを用いた遺伝子発現解析を支援します。
FastQC等による品質評価（QC）、リードマッピング、発現定量などの一次解析から、 発現比較解析、クラスタリング、ヒートマップ作成、パスウェイ解析などの二次解析まで幅広く対応可能です。
非モデル生物における解析や、論文化を見据えたデータ可視化・解析設計にも対応いたします。 -
De novo assembly
リファレンスゲノムを持たない非モデル生物に対する De novo transcriptome assemblyを実施します。
Trinity等を用いたトランスクリプトーム再構築に加え、 ORF予測や機能アノテーション、発現解析への接続まで一貫した解析支援を行います。
公開ゲノム情報の少ない生物種にも対応可能です。 -
分子系統解析
DNA・RNA・アミノ酸配列を用いた分子系統解析を実施します。
系統樹作成、ハプロタイプ解析、進化解析、配列比較解析などに対応し、 論文化を見据えた図作成・解析支援を行います。
大規模ハプロタイプ解析にも対応可能です。 -
解析コンサルティング
研究目的や取得データに応じた解析計画立案を支援します。
「何を解析すればよいかわからない」 「どの解析手法を選択すべきかわからない」 といった段階からご相談可能です。
論文化を見据えた解析戦略設計や、 共同研究における技術支援にも対応いたします。 -
データ加工用ソフトウェア開発
研究データ処理や解析補助を目的としたソフトウェア・ツール開発を行います。
CSV・Excelデータ加工、配列データ整理、自動化スクリプト作成など、 研究現場に合わせた小規模ツール開発に対応可能です。
研究業務の効率化や再現性向上を支援します。
タンパク質立体構造解析
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AlphaFold2等によるタンパク質立体構造予測
AlphaFold2等を用いたタンパク質立体構造予測解析を支援します。
単一タンパク質のみならず、多数タンパク質を対象としたハイスループット解析や、 ドメイン構造解析、ポケット予測、機能推定などにも対応可能です。
webツールや通常のPCでは困難な高分子タンパク質の立体構造予測やRNA-seq由来ORF配列から大規模立体構造予測も対応可能で、 従来困難とされていた非モデル生物やニッチ領域に対する創薬標的探索へ接続する解析も得意としています。 -
ドッキングシミュレーション
タンパク質立体構造情報を基盤とした in silicoドラッグスクリーニングを実施します。
既知タンパク質構造やAlphaFold等により予測された構造を用い、 AutoDock Vina等によるドッキングシミュレーションを行います。
候補化合物選定や結合部位解析、相互作用解析などを支援します。 -
分子動力学（MD）シミュレーション
タンパク質-リガンド相互作用や構造安定性解析を目的とした 分子動力学（MD）シミュレーションを実施します。
ドッキング解析のみでは評価が難しい結合安定性や構造変化を時系列で解析し、 候補化合物評価やタンパク質機能解析を支援します。
AlphaFold予測構造や既知PDB構造を用いたシミュレーションにも対応しています。
統計解析
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統計解析支援（JMP等）
JMP等を用いた統計解析支援を行います。
群間比較、多変量解析、相関解析、可視化など、 研究データに応じた統計解析を支援します。 -
統計コンサルティング
研究計画段階における統計設計や、 論文化時の解析方針相談にも対応します。
査読対応や追加解析方針についてもご相談可能です。
事務作業効率化
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データ入力・加工・編集支援
研究データ・事務データの入力、加工、整理を支援します。
Excel・CSV・テキストデータ等の整形、自動処理、 データ統合などに対応可能です。 -
業務効率化ツール開発
研究室業務や事務作業を効率化する 小規模ツール・スクリプト開発を行います。
定型作業自動化やデータ整理支援など、 研究現場に合わせた柔軟な対応が可能です。
IT・PCサポート
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PC作業環境の構築・最適化支援
研究用途に応じたPC環境構築や解析環境セットアップを支援します。
Linux、Windows、macOS環境に対応し、 解析ソフトウェア導入や環境最適化を行います。 -
ネットワーク環境構築支援
研究室・小規模事業向けのネットワーク環境構築を支援します。
NAS導入支援、ファイル共有環境整備、 リモートアクセス環境構築などにも対応可能です。